ディスクミラーリングツール(windows)
オリジナル
Unicode対応版

このソフトを使っています。他に、下記のソフトを検討したことがありますが、GUIで簡単操作、「テスト」モードがあること、バックアップするフォルダから、指定のサブフォルダ、ファイルを除外することができる点から、このソフトを選びました。

ターゲット指定で、除外するフォルダを指定できますが、これは、絶対指定ではなく、相対指定です。

robocopy (windows)
マイクロソフト製のコマンドタイプのソフト。
高性能らしいのですが、コマンド入力なので、とっつきにくいです。

使い方は、下記のHPなど
ITmedia
@IT

RichCopy (windows)
ユーティリティスポットライト
マイクロソフト製のGUIタイプのソフト。
単純なミラーリングコピーなら、これで、十分です。ディスクミラーリングソフトより、わかりやすいと思います。

stroy (Java)
Javaで、作成されたフォルダ（ディレクトリ）のファイル比較ソフト。
svn関係の除外などが、デフォルト設定されているので、設定が楽です。